Le système de filtration se compose généralement de plusieurs filtres :
- un premier filtre protège la pompe, il se situe entre la cuve et la pompe
- le second niveau de filtration se trouve entre la pompe et le système de régulation. Ce niveau de filtration est optionnel
- un troisième niveau de filtration est positionné après les vannes de coupure de tronçons
- enfin, un dernier niveau peut être  positionné au niveau des diffuseurs

La capacité de filtration est indiqué par le nombre de mesh (en anglais maille) qui correspond au nombre de fils par pouce (1 pouce = 25,4 mm). Plus le nombre est élevé, plus la filtration est poussée.

Indication de la finesse des filtres :
- filtre situé à l’aspiration : 32 à 50 mesh
- filtre de tronçon : 50 à 80 mesh
- filtre au niveau des buses : 80 à 200 mesh (de 80 à 100 en pratique)

Pour rappel :
La capacité de filtration des derniers niveaux de filtration doivent être adaptés en fonction des préconisations de fournisseurs de buses. En effet, les différents fournisseurs de buses précisent le niveau de filtration adapté à chaque référence de buse.